微生物采樣器主要包括微生物采水器、采泥器和柱狀取樣管等。微生物采水器用于采集海水中的微生物樣品，由機架和采水瓶兩部分組成，將其沉放到預定深度時，投放下墜鐵塊敲擊杠桿后部，杠桿前端挑起，將玻璃管擊斷，使海水進入采水器瓶內。復背式采水器由一個厚壁橡皮球附加在顛倒采水器上構成，采水器顛倒時，把球口上的塞子拉下，海水進入橡皮球中。無菌采水袋由無菌塑料袋和采水機架組成，采水袋沉放到預定采水深度時，使錘或切刀將水嘴打開，海水流入。采泥器和柱狀取樣管也可用來采集底質中的微生物樣品。
微生物采樣器功能技術：
（1）采樣功能：可實現等時混合采樣、流量等比例采樣（配的流量探頭）、任意超標因子（COD、氨氮、總磷、總氮、重金屬等）外控采樣、遠程控制隨機采樣等多種采樣方式。
（2）分瓶留樣功能：可實現1～24瓶任意留樣，留樣瓶數和方式可自由設定。
（3）供樣功能：可向COD、氨氮、總磷、總氮、重金屬等多臺在線監測儀同時提供等時混合水樣，緩存盒自帶攪拌混勻功能。
（4）排空潤洗功能：系統可自動排空緩存盒內存水，下次采樣前可自動反吹及潤洗采樣管路，保證管路通暢和每次采集樣品真實性和代表性。
（5）采樣信息記錄功能：可記錄每次留樣時間、瓶號、留樣量、超標信息等，可記錄8000條數據，循環更新。
（6）通信功能：RS-232、RS-485；4mA～20mA。
（7）斷電保護功能：儀器在運行狀態突然下斷電并重新上電后，儀器能自動恢復原運行狀態，斷電后儀器參數不丟失。
（8）開關門記錄：可檢測采樣器的開關門狀態并記錄每次開關門的時間，可記錄新的2000條數據記錄。
（9）停電記錄：可記錄儀器斷電和上電的時間，可記錄新的2000條數據。
（10）語音播報功能。
（11）打印功能。
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